Плазмиды имеют изменчивую структуру и существуют в стабильной форме только в том случае, если этому способствуют условия среды. Например, когда с определенной плазмидой связана катаболическая функция, присутствие субстрата-ксенобиотика стабилизирует ее структуру в процессе популяционной автоселекции. При отсутствии селективного давления (ксенобиотика) автономные плазмиды быстро элиминируются, но стабильны после включения их в хромосому.
Таким образом, генетическая конструкция и механизмы переноса генов обеспечивают необходимую пластичность бактериального генома и метаболизма ксенобиотиков микроорганизмами, их адаптацию к различным соединениям и быстрое распространение необходимых генов внутри популяции.
По молекулярной массе и числу копий в клетке плазмиды можно разделить на две группы: крупные, как правило, трансмиссивные плазмиды с молекулярной массой (30-100)· IO6, число копий в клетке небольшое (по 1-2 на хромосому); мелкие нетрансмиссивные плазмиды с молекулярной массой (1-10)· 10 , число копий в клетке 10-15 и более на хромосому. Существует классификация по несовместимости. Совместимые плазмиды могут существовать одновременно в одной и той же клетке, несовместимые неспособны сосуществовать в одной и той же бактериальной клетке.
Плазмиды различают также по свойствам, которые они придают бактериальным клеткам.
Факторы фертшъности (F-факторы) - включаются B4 бактериальную хромосому, мобилизуют генетическую информацию хромосомы и переносят ее в другую клетку в результате конъюгации.
Факторы резистентности (R-плазмиды, R-факторы) содержат гены, которые определяют устойчивость клетки к различным веществам, в том числе к антибиотикам (сульфонамидам, стрептомицину, хлорамфениколу, тетрациклину, канамицину и др.) и тяжелым металлам (ртути, никелю, кадмию, кобальту). Кроме того, они могут определять устойчивость к мутагенам. Устойчивость, обусловленная R-плазмидами, чаще всего обеспечивается ферментами, модифицирующими молекулу антибиотика или тяжелого металла. Устойчивость к сульфаниламиду обусловлена тем, что R-плазмиды детерминируют дублирующие ферменты синтеза витаминов, нечувствительные к этому лекарственному препарату.