Биологические факторы загрязнения (чаще всего микробные) можно классифицировать следующим образом:
1. живые микроорганизмы с природным геномом, не обладающие токсичностью, сапрофиты;
2. живые микроорганизмы с природным геномом, обладающие инфекционной активностью, патогенные и условно-патогенные, вырабатывающие токсины;
3. живые микроорганизмы, получаемые методами генной инженерии (генетически модифицированные микроорганизмы, содержащие чужие гены или новые комбинации генов - ГММО);
4. инфекционные и другие вирусы;
5. токсины биологического происхождения;
6. инактивированные клетки микроорганизмов (вакцины, пыль термически инактивированной биомассы микроорганизмов кормового и пищевого назначения);
7. продукты метаболизма микроорганизмов;
8. органеллы и органические соединения клетки - продукты ее фракционирования.
Биологические факторы загрязнения могут быть естественного и техногенного происхождения.
Факторы естественного происхождения:
• возбудители и переносчики инфекционных заболеваний людей, животных, растений;
• пыльца растений (аллерген), цианобактерии и их токсины, накапливаемые при цветении водоемов;
• заплесневелые предметы и продукты;
• биологическая коррозия и эрозия, связанные с жизнедеятельностью бактерий и грибов - колонизаторов тканей, бумаги, древесины и других органических материалов, строительных материалов и изделий из камня, скульптур, фресок и других произведений искусства.
Факторы техногенного происхождения:
• вакцины и сыворотки, лекарственные препараты, физиологически активные вещества;
• микробиологические средства защиты растений, биологически активные вещества, микробная биомасса, препараты кормового и технического назначения, биопрепараты для очистки различных сред.